山西谷子种质资源株高全基因组关联分析

作     者：阳世杰 王华智 潘怡敏 黄蕊 侯森 秦慧彬 穆志新 王海岗 

作者机构：山西农业大学农学院 山西农业大学农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：山西省科技重大专项计划“揭榜挂帅”项目(202101140601027) 国家自然科学基金项目(32241041) 山西农业大学生物育种工程(YZGC149)项目资助 

主　　题：谷子 株高 全基因组关联分析 单倍型 候选基因 

摘      要：适宜的株高能够有效增强谷子养分利用效率和抗倒伏能力。本研究以313份山西谷子地方品种微核心种质为关联群体，在5个环境下调查谷子株高，对其进行全基因组深度重测序，数据质量控制后得到均匀分布于谷子9条染色体的3，160，066个SNP标记，进行株高全基因组关联分析(GWAS)。共定位到8个与株高显著关联QTL位点，单个位点表型变异解释率为7.13%～12.08%。在8个稳定QTL位点上下游各25 kb的置信区间共发现40个候选基因，结合基因注释信息等筛选到6个候选基因主要参与激素合成、细胞分裂调控、信号转导和糖类物质代谢等途径，并通过单倍型分析发现Millet＿GLEAN＿10031852候选基因的一个优异单倍型Hap2可以有效降低株高。