小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用

作     者：孙雪 吴晓微 李兴文 裴鲁青 SUN Xue,WU Xiao-wei,LI Xing-wen,PEI Lu-qing(Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology of Ministry of Education,Ningbo University,Ningbo 315211,China)

作者机构：宁波大学教育部应用海洋生物工程重点实验室 

出 版 物：《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期：2009年第33卷第4期

页      面：565-571页

核心收录：

学科分类：090502[农学-动物营养与饲料科学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金(30700610) 浙江省教育厅项目(20040899) 宁波市自然科学基金项目(2006A610084) 

主　　题：小球藻 内转录间隔区 rbcL基因 遗传距离 种间关系 种内关系 

摘      要：用核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)和叶绿体rbcL基因对小球藻属(Chlorella)6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列(ITS和rbcL序列各为15条)一起进行比较分析。结果显示:ITS序列长度在小球藻种内高度保守,在种间变异较大;而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0.000~0.663之间;而15株小球藻rbcL序列间距离在0.000~0.216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系;蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近;椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远。研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定。