生物信息学方法分析锌指蛋白605在肝癌中的免疫作用及预后价值

作     者：罗天新 陈晓梅 吴湘怡 龙治燕 张姝 黄健 LUO Tian-xin;CHEN Xiao-mei;WU Xiang-yi;HUANG Jian

作者机构：贵州医科大学医学检验学院临床检验生化教研室贵州贵阳550004 织金县中医医院 贵州医科大学医学检验学院临床检验基础与血液学教研室贵州贵阳550004 

出 版 物：《中西医结合肝病杂志》 (Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Medicine on Liver Diseases)

年 卷 期：2024年第34卷第8期

页      面：713-719页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(No.81960589) 

主　　题：肝细胞癌 锌指蛋白605 生物信息学 免疫浸润 诊断 预后 

摘      要：目的:探讨锌指蛋白605(ZNF605)在肝细胞癌(HCC)中的免疫作用及预后价值。方法:应用TCGA、GEO等数据库分析ZNF605在HCC中的表达情况,并分析ZNF605表达水平与HCC患者临床病理特征的相关性;应用UALCAN数据库探讨ZNF605在HCC中的甲基化表达水平;应用受试者操作特征(ROC)曲线分析ZNF605在HCC中的诊断价值并绘制诺模图,预测HCC患者1、3和5年总生存率;单因素及多因素Cox回归分析ZNF605在HCC中的预后价值;对ZNF605的高低水平表达进行了基因富集分析(GSEA);应用R包-GSVA分析ZNF605的表达水平与肿瘤微环境中免疫细胞的相关性。结果:ZNF605在多种癌症中异常表达,在HCC中高表达并呈低甲基化;ZNF605高表达与患者T分期、临床分期、组织学分级总生存期和甲胎蛋白相关;单因素及多因素Cox回归分析显示ZNF605表达及T分期为HCC的独立预后风险因素;GSEA分析显示ZNF605高表达主要富集在细胞周期;免疫细胞浸润分析提示,ZNF605在HCC中的表达水平与Th2细胞和T辅助细胞呈显著正相关;与树突状细胞细胞、Th17细胞、细胞毒性细胞、中性粒细胞、浆细胞样树突状细胞、B细胞、Tgd细胞和肥大细胞等呈负相关。结论:生物信息学分析结果表明,在HCC中高表达的ZNF605可能是HCC的诊断及预后生物标志物,可能成为潜在的治疗靶点。