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两对互作基因重组率EM算法估计的模拟研究

The Monte Carlo simulation on the estimate of recombination rate between two interactional genes using EM algorithm

作     者:章元明 盖钧镒 ZHANG Yuanming;Gai Junyi

作者机构:南京农业大学大豆研究所 

出 版 物:《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期:2001年第24卷第2期

页      面:24-27页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:973项目 (G19980 10 2 0 6) 

主  题:期望最大化 (EM)算法 重组率 MonteCarlo模拟 基因互作 植物 

摘      要:推导出存在上位性互作的两对连锁基因在F2 群体中各表型的概率和条件概率以便利用EM (expectationandmaximization :期望最大化 )算法估计重组率 ,还获得了重组率的标准误公式。通过MonteCarlo模拟发现 :用EM算法和Fisher法估计重组率时其结果一致 ;前者易推广到两基因间具有上位性互作的情形 。

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