两对互作基因重组率EM算法估计的模拟研究
The Monte Carlo simulation on the estimate of recombination rate between two interactional genes using EM algorithm作者机构:南京农业大学大豆研究所
出 版 物:《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)
年 卷 期:2001年第24卷第2期
页 面:24-27页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
主 题:期望最大化 (EM)算法 重组率 MonteCarlo模拟 基因互作 植物
摘 要:推导出存在上位性互作的两对连锁基因在F2 群体中各表型的概率和条件概率以便利用EM (expectationandmaximization :期望最大化 )算法估计重组率 ,还获得了重组率的标准误公式。通过MonteCarlo模拟发现 :用EM算法和Fisher法估计重组率时其结果一致 ;前者易推广到两基因间具有上位性互作的情形 。