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利用支持向量机预测生物膜蛋白类型

Prediction of Membrane Protein Types by Using Support Vector Machine

作     者:郭宗明 张治洲 潘宇曦 黄振德 冯国鄞 贺林 GUO Zong-ming,ZHANG Zhi-zhou,PAN Yu-xi,HUANG Zhen-de,FENG Guo-yin,HE Lin (Bio-X Life Science Research Center, Shanghai Jiaotong Univ., Shanghai 200030, China)

作者机构:上海交通大学Bio-X生命科学研究中心上海200030 

出 版 物:《上海交通大学学报》 (Journal of Shanghai Jiaotong University)

年 卷 期:2004年第38卷第5期

页      面:806-809页

核心收录:

学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 

基  金:教育部科学技术研究重点项目:蛋白组学新方法研究(03066) 

主  题:支持向量机 生物膜蛋白 氨基酸组分 

摘      要:利用统计学习理论中的支持向量机(SVM),基于氨基酸组分含量预测生物膜蛋白类型.使用文献中2059个训练集和2625个检验集膜蛋白序列数据,运用统计预测中的校准检验,留一法交叉检验和独立数据集检验方法进行分类预测.结果表明,SVM对膜蛋白类型预测具有明显的优越性,该算法对当前已有方法起到重要的补充作用.

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