紫花苜蓿FBA基因家族成员的鉴定与分析
Identification and analysis of members of the FBA gene family in alfalfa作者机构:宁夏大学林业与草业学院宁夏银川750021 宁夏大学宁夏草牧业工程技术研究中心宁夏银川750021 宁夏大学农业农村部饲草高效生产模式创新重点实验室宁夏银川750021
出 版 物:《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)
年 卷 期:2024年第33卷第9期
页 面:81-93页
核心收录:
学科分类:090503[农学-草业科学] 0909[农学-草学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学]
基 金:国家自然科学基金(32101426) 宁夏自然科学基金(2023AAC05019)资助
主 题:紫花苜蓿 FBA基因家族 生物信息学 生长发育 非生物胁迫
摘 要:果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(FBA)是糖酵解、糖异生和卡尔文循环中的关键酶,在调控植物生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在全基因组水平对紫花苜蓿FBA基因家族进行了鉴定,并对其理化性质、系统进化关系、染色体定位、基因结构特征、启动子顺式作用元件和基因表达模式进行了分析。研究结果表明,紫花苜蓿中有11个MsFBA基因,分布于1、4、5、7、8号染色体和contig633end上。理化性质分析结果表明,MsFBAs编码111~437个氨基酸,预测都为亲水性蛋白。系统进化关系分析表明,MsFBA家族蛋白被分为2个亚家族,MsFBA蛋白在不同物种间保守性较高。紫花苜蓿与拟南芥和蒺藜苜蓿FBAs之间的共线性分析结果显示,紫花苜蓿与蒺藜苜蓿之间的同源性更高。启动子顺式作用元件预测结果表明,MsFBAs启动子区域存在很多植物激素响应元件和非生物胁迫响应元件。对MsFBA基因在不同组织和非生物胁迫下的表达模式分析表明,MsFBAs在地上组织中的表达量明显高于地下组织,具有组织表达特异性;MsFBA基因的表达受低温、脱落酸、干旱、盐胁迫的诱导,说明MsFBAs在调控非生物胁迫方面具有重要作用。本研究可为进一步研究紫花苜蓿FBA基因的功能提供理论支撑。