龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒基因特征分析

作     者：廖琳虹 何云 陈前进 曹春远 吴水新 张彦锋 何春荣 LIAO Lin-hong;HE Yun;CHEN Qian-jin;CAO Chun-yuan;WU Shui-xin;ZHANG Yan-feng;HE Chun-rong

作者机构：龙岩市疾病预防控制中心 福建医科大学龙岩市疾病预防控制中心教学点福建龙岩364000 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2014年第9卷第11期

页      面：987-991页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：福建省卫生厅青年科研课题项目(No.2012-1-47) 

主　　题：手足口病 柯萨奇病毒B5 VPl区 种系分析 

摘      要：目的了解龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒（Coxsackie virus B5,CVB5）VP1区基因特征及变异情况。方法对2011年采自确诊手足口病患者的Real-time RT-PCR法检测肠道病毒通用引物阳性而肠道病毒71型（enterovirus 71,EV 71）和柯萨奇病毒A 16型（Coxsackie virus A 16,CVA16）阴性未分型样品,经RD细胞分离肠道病毒。从培养上清中提取RNA核酸,经RT-PCR法初步鉴定病毒型别。应用187/222引物对扩增病毒株的VP1区,回收产物经克隆、筛选后测序。采用ClustalX、Mega5.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和进化树构建。结果 104份未分型样品中分离到3株CVB5。3株CVB5分离株VP1区长度为330-357个核苷酸,编码110-119个氨基酸。3株间的核苷酸同源性为97%-99%,氨基酸同源性为84%-99%。比较推导的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1与另外2株龙岩分离株相比有18个位点差异,核苷酸序列287-288位发生插入突变,第290、291、338、339位发生颠换,与2010年长春株JN695051的同源性最高（核苷酸同源性95%-98%,氨基酸同源性84%-99%）。结论 2011年福建省龙岩市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒与2005年法国株和国内山东、长春、昆明、浙江病毒株属同一型别。