基于网络药理学及分子对接探讨菊花抗炎的作用机制

作     者：洪梦杰 于白音 柏超凡 张朝玉 刘洁连 HONG Mengjie;YU Baiyin;BAI Chaofan;ZHANG Chaoyu;LIU Jielian

作者机构：河南科技职业大学医学院河南周口466000 韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室广东韶关512005 韶关学院生物与农业学院广东韶关512005 南雄市乡村振兴服务中心广东南雄512400 广东华暨农业科技有限公司广东韶关512000 

出 版 物：《韶关学院学报》 (Journal of Shaoguan University)

年 卷 期：2024年第45卷第6期

页      面：6-13页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：河南科技职业大学校级科研项目(HZDKYL2023-014) 韶关市南雄市省级南药产业园项目(粤农农计6号) 韶关学院重点项目(SZ2022KJ04) 

主　　题：菊花 炎症 网络药理学 分子对接 

摘      要：基于网络药理学和分子对接验证方法探讨菊花抗炎的作用机制.先从TCMSP数据库筛选17个菊花活性成分和109个对应靶点,再从GeneCards、NCBI、OMIM和DisGeNET数据库筛选出2492个炎症靶点;然后将菊花活性成分靶点和炎症靶点取交集得到菊花抗炎的潜在靶点;再通过构建潜在靶点PPI网络并进行拓扑分析得到菊花抗炎的核心靶点;并利用DAVID数据库对核心靶点进行GO和KEGG富集分析后,利用Cytoscape 3.9.1软件构建“活性成分-核心靶点-通路网络并进行拓扑分析,得到菊花抗炎的关键成分和关键靶点;最后运用AutoDock Vina对菊花抗炎的关键成分和关键靶点进行分子对接验证,根据对接结合能利用Origin软件绘制热图,分析结合能大小.结果表明,基于网络药理学,共筛选到菊花抗炎潜在靶点56个;再经PPI网络拓扑分析得到菊花抗炎的核心靶点21个;核心靶点经富集分析及“活性成分-核心靶点-通路网络拓扑分析,最终得到菊花抗炎的9个关键成分和9个关键靶点;分子对接验证结果显示,菊花抗炎的关键活性成分和关键靶点结合良好,构象稳定.