转录组测序分析梨种子催芽过程涉及ABA通路的关键基因

作     者：孙新菊 SUN Xinju

作者机构：南京特殊教育师范学院南京210038 

出 版 物：《中国南方果树》 (South China Fruits)

年 卷 期：2024年第53卷第4期

页      面：125-131页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：江苏省教育科学“十三五”规划青年专项重点资助项目(C-a/2020/01/14)资助 

主　　题：梨 种子 休眠解除 脱落酸 转录组 

摘      要：种子休眠与萌发受到内源激素和外界环境等多种因素的调控。生产上常采用清水浸泡和低温砂藏层积处理方法打破梨种子休眠进程,促进种子萌发。为解析梨种子休眠解除的分子机制,以翠冠梨干种子为研究对象,通过清水浸泡6 h再低温砂藏60 d进行催芽。对该过程17个时期种仁ABA含量进行测定,结果显示在种子浸泡过程和低温砂藏7 d阶段ABA含量整体呈现下降趋势,随后趋于稳定。选取其中7个关键时期样品进行转录组测序,GO分析结果显示差异基因被分配到40个功能组,KEGG分析结果显示差异基因主要富集在核糖体、多样化环境中微生物代谢、碳代谢、辅因子的生物合成和氨基酸的生物合成通路。通过转录组测序获得的基因FPKM值和ABA含量数据构建共表达网络,结果显示11个基因(Pbr009501、Pbr016256、Pbr011612、Pbr033750、Pbr015393、Pbr000885、Pbr037755、Pbr039726、Pbr020341、Pbr003677和Pbr015873)与ABA含量的相关性均极高,相关性系数达到0.91~0.96。研究结果为挖掘梨种子休眠和萌发过程调控ABA水平的关键基因提供了重要信息。