甜橙AP2亚家族转录因子的鉴定与分析
Identification and analysis of AP2 subfamily transcription factors in sweet orange(Citrus sinensis)作者机构:江西农业大学农学院南昌330045
出 版 物:《果树学报》 (Journal of Fruit Science)
年 卷 期:2024年第41卷第8期
页 面:1490-1503页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:江西省自然科学基金-杰出青年基金(20224ACB215006) 国家自然科学基金(32360735) 江西省柑橘产业技术体系(JXARS-07-栽培岗位)
主 题:甜橙 AP2亚家族 基因鉴定 非生物胁迫 生物信息学 表达分析
摘 要:【目的】AP2亚家族转录因子具有调控植物种子、叶、花、根、茎等器官发育和响应非生物及生物胁迫的功能。对甜橙AP2亚家族进行基因鉴定、生物信息学分析和表达分析,为深入研究甜橙AP2亚家族基因的生物学功能提供理论基础。【方法】利用生物信息学分析方法,对甜橙AP2亚家族基因进行筛选与鉴定,通过qRT-PCR分析基因在不同组织部位以及不同非生物胁迫下的表达模式。【结果】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,不均等分布在6条染色体上,其编码蛋白均为不稳定的亲水性蛋白。甜橙AP2亚家族基因在根、茎、叶中的表达存在差异,且多数基因可以被干旱和高盐胁迫诱导表达。【结论】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,它们可能在甜橙响应非生物胁迫过程中起重要作用。