过表达GATA2对鸡前脂肪细胞转录表达的调控作用及机制

作     者：王英军 张停停 王小沛 周心北 陈月婵 张志威 Wang Yingjun;Zhang Tingting;Wang Xiaopei;Zhou Xinbei;Chen Yuechan;Zhang Zhiwei

作者机构：石河子大学组织胚胎学教研室石河子832000 石河子大学医学院新疆地方与民族高发病教育部重点实验室石河子832000 石河子大学第一附属医院生殖医学科石河子832000 

出 版 物：《安徽医科大学学报》 (Acta Universitatis Medicinalis Anhui)

年 卷 期：2024年第59卷第7期

页      面：1157-1165页

学科分类：0710[理学-生物学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(编号:32360825、31960647、31501947) 石河子大学青年创新拔尖人才项目(编号:CXBJ201905) 

主　　题：鸡 前脂肪细胞 GATA2 RNA-seq ChIP-seq 富集分析 GESA分析 

摘      要：目的阐明过表达GATA2对鸡前脂肪细胞转录表达的影响。方法培养鸡前脂肪细胞ICP1,转染pCMV-myc-GATA2或pCMV-myc质粒,Western blot验证细胞中GATA2过表达情况,RNA-seq研究过表达GATA2对细胞转录组表达变化,ChIP-seq研究GATA2在基因组的结合情况,Real-time PCR验证部分差异表达基因、ChIP-PCR验证GATA2对TAF3基因的集合情况。结果转染pCMV-myc-GATA2可以在ICP1细胞过表达GATA2蛋白,过表达GATA2后,ICP1细胞中942个基因表达上调,840个基因表达下调(P0.05),富集分析显示差异表达基因与核糖体和线粒体的结构和功能相关(P0.01);GESA分析显示,过表达GATA2的ICP1细胞中RNA聚合酶Ⅱ转录起始复合物、核糖体生物生成、丙酸代谢和氧化磷酸化相关基因集表达上调;组蛋白赖氨酸N甲基转移酶、核转录抑制复合体形成、脂肪因子和钙离子等信号通路相关基因集表达下调。ICP1细胞中ChIP-seq鉴定出2833个GATA2结合的基因组峰,涉及2018个基因。Motif分析显示GATA2结合(T/A)GATA模序;富集分析显示这些基因参与胚胎发育、信号传导、细胞代谢和细胞间相互作用。差异表达基因和GATA2结合基因取交集获得105个基因,富集分析显示这些基因与转录、转录后调控、细胞间相互作用、信号传导和细胞周期相关(P0.001)。结论GATA2可以与鸡前脂肪细胞的基因组结合调节其转录组表达模式。