结肠癌肝转移与肺转移关键基因集筛选及功能分析

作     者：甘国容 罗莉 罗丽娜 王永祥 李俊 Gan Guorong;Luo Li;Luo Lina

作者机构：自贡市第一人民医院四川自贡643000 中南大学湘雅医学院湖南长沙410000 

出 版 物：《四川医学》 (Sichuan Medical Journal)

年 卷 期：2024年第45卷第7期

页      面：726-733页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：结肠癌肝转移 结肠癌肺转移 预后 免疫 

摘      要：目的挖掘结肠癌转移的关键基因及其临床意义。方法基于TCGA和GEO(GSE41258)中的结肠癌数据集,利用WGCNA包和Limma包分析结肠癌转移相关的基因集,并分析基因集对预后及肿瘤临床分其的影响。随后利用Metascape构建每一个关键基因的蛋白互作网络,并利用DAVID根据蛋白互作网络进行功能富集分析。最后,利用TIDE数据库,从免疫角度分析关键基因对细胞毒性T细胞的免疫浸润以及免疫应答的影响。结果本研究筛选出了CNN1、CXCL10、CXCL11、MGP、SPINK4和PBK 6个关键基因,不仅影响患者预后,同时与结肠癌的肿瘤分期呈现线性关系。通过KEGG与GO富集发现结肠癌肝转移关键基因网络调控细胞因子功能、中心粒细胞驱化以及单核细胞驱化等免疫过程,而在结肠癌肺转移关键基因网络调控RAS信号通路,这些结果揭示了结肠癌不同转移途径的机制差异。其中,CNN1、MGP抑制细胞毒性T细胞的免疫应答,PBK促进细胞毒性T细胞的免疫应答。结论CNN1、CXCL10、CXCL11、MGP、SPINK4和PBK 6个基因可以作为结肠癌转移的筛查分子标志物,并在结肠癌的免疫治疗中发挥作用,为潜在的结肠癌的治疗靶标。