IBDVvp2基因高变区序列测定与进化分析

作     者：闫笑 李天宪 范兆军 寇铮 陈绳亮 

作者机构：中国科学院武汉病毒研究所湖北武汉430071 

出 版 物：《中国病毒学》 (Virologica Sinica)

年 卷 期：2004年第19卷第6期

页      面：620-623页

核心收录：

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家科技攻关计划项目(2004BA519A11) 

主　　题：鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV) vp2基因 高变区 超强毒株 

摘      要：本实验采用来源于江苏地区的六株不同鸡传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)毒株,应用 RT-PCR 法对 vp2 基因高变区进行了扩增,构建重组质粒 pMD18T- vp2,测序。与有代表性的 IBDV 毒株 VP2 基因高变区序列进行比较分析,以 ClustalX 软件进行序列比对,得到基因序列及氨基酸序列同源性,IBDVY3、P2G、P8G、SZ、Y5 和 W04(6 株)IBDV 与 D6984(荷兰)的同源性达到 99.0%以上,与其它一些超强毒株(very virulent IBDV,vvIBDV)的同源性也达到了 97.8%以上,并在关键氨基酸位点符合 vvIBDV 特征,采用Phylip3.5 软件分析作出进化树,其结果从分子水平说明六个毒株均为 vvIBDV,与欧洲和日本的超强毒株有较近的亲缘关系,而与美洲株的较远,从而为 IBDV 分子流行病学研究和疫苗的研制提供了科学依据。