基于NK相关基因的急性髓细胞白血病预后风险评估模型的建立

作     者：梅殿凤 项丹 毛晨晨 周海霞 薛向阳 朱珊丽 MEI Dianfeng;XIANG Dan;MAO Chenchen;ZHOU Haixia;XUE Xiangyang;ZHU Shanli

作者机构：温州医科大学基础医学院微生物学与免疫学教研室分子病毒与免疫研究所浙江温州325035 温州医科大学附属第二医院育英儿童医院儿科研究室温州市儿童血液肿瘤疾病研究重点实验室浙江温州325027 

出 版 物：《温州医科大学学报》 (Journal of Wenzhou Medical University)

年 卷 期：2024年第54卷第7期

页      面：563-573页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：温州市基础性科研项目(Y2020215) 

主　　题：急性髓细胞白血病 NK细胞相关基因 风险评估模型 肿瘤免疫微环境 

摘      要：目的:通过分析NK细胞相关基因(NRGs)在急性髓细胞白血病(AML)中的表达模式及其与预后的关系,构建新型风险评分模型以评估AML患者的预后。方法:基于生物信息学的方法下载TCGA数据库中AML转录组数据。根据NRGs的表达不同,通过无监督聚类将AML患者分组,并分别分析不同亚组AML患者的生存差异、基因功能富集情况和免疫相关分析。根据亚组的差异表达基因,通过Cox生存分析以及LASSO回归分析构建基于NRGs的预后评估模型。最后收集AML患者的骨髓样本进行转录组测序,进一步验证预后评估模型中各基因与AML的相关性。结果:单因素Cox筛选与预后相关的NRGs,并根据其表达情况将AML患者分成3个亚组。生存分析以及富集分析、免疫浸润分析、免疫检查点分析均发现亚组2具有更好的临床预后,并且免疫微环境明显重塑。进一步根据三个亚组的差异表达基因,通过Cox联合LASSO回归分析构建风险评分模型,此风险评分模型与AML的临床预后显著相关。临床病例的转录组测序结果表明,风险模型的6个AML危险基因中,ADGRG1、LSP1、PDE7B在复发患者中的表达量较缓解患者上调,保护基因TBX1的表达量则下调。结论:本研究构建的AML患者风险评分模型可作为一种新的预后评估手段,具有较好的预测价值。