植物IPP基因的生物信息学分析

作     者：喻心怡 冀慧玥 路萍萍 周嘉裕 廖海 

作者机构：西南交通大学生命科学与工程学院 

出 版 物：《植物研究》 (Bulletin of Botanical Research)

年 卷 期：2024年

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32270410) 

主　　题：异戊烯基焦磷酸异构酶 生物信息学 干旱胁迫 脱落酸 表达模式 

摘      要：异戊烯基焦磷酸异构酶（IPP）催化异戊烯焦磷酸与二甲基丙烯基焦磷酸(DMAPP)的可逆异构化反应，对下游萜类产物的合成发挥重要作用。该研究利用生物信息学方法，从稻（Oryza sativa）与拟南芥（Arabidopsis thaliana）等单双子叶植物基因组中鉴定获得31条IPP基因。系统进化树将IPP分为3簇，其中单子叶植物单独形成一簇。同簇的IPP成员具有相似的结构域，可能执行相似的生物学功能。以稻与拟南芥IPP基因为代表，顺式调控元件分析显示它们含有干旱等响应元件。最后，定量PCR结果显示，稻与拟南芥IPP转录水平的表达模式较为多样化。以上研究结果为系统认识IPP基因的生物学作用及可能的应用研究提供理论依据。