InDel标记的研究和应用进展

作     者：杨洁 赫佳 王丹碧 施恩 杨文宇 耿其芳 王中生 Jie Yang;Jia He;Danbi Wang;En Shi;Wenyu Yang;Qifang Geng;Zhongsheng Wang

作者机构：南京大学生命科学学院南京210023 

出 版 物：《生物多样性》 (Biodiversity Science)

年 卷 期：2016年第24卷第2期

页      面：237-243页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金(31100270) 

主　　题：分子标记 In Del SNP SSR 

摘      要：InDel是指在近缘种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺失(insertion-deletion),是同源序列比对产生空位(gap)的现象。InDel在基因组中分布广泛、密度大、数目众多。InDel多态性分子标记是基于插入/缺失位点两侧的序列设计特异引物进行PCR扩增的标记,其本质仍属于长度多态性标记,可利用便捷的电泳平台进行分型。InDel标记准确性高、稳定性好,避免了由于特异性和复杂性导致的后续分析模糊。此外,InDel标记能扩增混合DNA样品和高度降解的微量DNA样品,并进行有效分型。InDel标记目前已开始应用于动植物群体遗传分析、分子辅助育种以及人类法医遗传学、医学诊断等领域。随着位于功能基因上InDel标记的开发,结合染色体步移和基因精细定位,可将这些标记应用于相关物种经济性状的功能基因的筛选,有利于优良基因的进一步开发和利用。