玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析

作     者：曹言勇 张立立 李慧敏 韩胜博 侯梦薇 段灿星 施艳 张新友 CAO Yan-yong;ZHANG Li-li;LI Hui-min;HAN Sheng-bo;HOU Meng-wei;DUAN Can-xing;SHI Yan;ZHANG Xin-you

作者机构：河南省农业科学院粮食作物研究所/神农种业实验室郑州450002 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 河南农业大学植物保护学院郑州450002 

出 版 物：《玉米科学》 (Journal of Maize Sciences)

年 卷 期：2024年第32卷第4期

页      面：110-118页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：河南省农业科学院自主创新基金项目(2023ZC010) 国家重点研发项目(2021YFD1200700) 

主　　题：玉米 九州镰孢菌 生物信息学 分泌蛋白 

摘      要：九州镰孢菌(Fusarium kyushuense)是一种重要的植物病原菌,可引起玉米茎腐病。为明确九州镰孢菌的分泌蛋白,运用SignalP 6.0、ProtComp 9.0、TMHMM 2.0、big-PI Predictor、TargetP 2.0等软件对九州镰孢菌全基因组12225条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测和筛选。结果表明,九州镰孢菌195全基因组蛋白中共有539条序列具有典型的分泌蛋白特征,占总序列数的4.41%。信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守,其切割位点属于A-X-A型。分泌蛋白功能注释分析结果表明,九州镰孢菌的分泌蛋白中共有264个效应蛋白,其功能主要涉及细胞壁组分降解。对碳水化合物活性酶类(CAZymes)进行预测发现,九州镰孢菌分泌蛋白组中共有168个碳水化合物活性酶,为进一步探究其生物学特性、致病机制和筛选新的镰孢菌致病效应蛋白奠定基础。