甘薯储藏期低温胁迫的转录组分析和关键基因挖掘

作     者：肖世卓 张毅 戴习彬 周志林 孙健 曹清河 Xiao Shizhuo;Zhang Yi;Dai Xibin;Zhou Zhilin;Sun Jian;Cao Qinghe

作者机构：江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室徐州221131 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2024年第25卷第7期

页      面：1163-1174页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：江苏省自然科学基金(BK20221213) 国家甘薯产业技术体系(CARS-10) 国家自然科学基金(M2242001) 江苏省重点研发计划(BE2021384) 

主　　题：甘薯 储藏 低温胁迫 转录组 类受体蛋白激酶 

摘      要：甘薯在储藏过程中受到低温冷害会大大降低甘薯的商品价值,因此研究甘薯耐低温储藏的分子机制,减少低温在甘薯储藏过程中的影响具有重要意义。本研究选取了较耐低温储藏、不耐低温储藏以及表现居中的3个甘薯品种商薯19(S19)、烟薯25(Y25)和苏薯16(S16),分别在9℃和6℃储藏35 d。提取上述处理的薯块总RNA进行转录组测序和比较分析,发现与对照相比,S19在低温储藏后的差异表达基因较少,而Y25则相反,S16居中。差异表达基因KEGG和GO分析发现,甘薯块根在低温胁迫下蛋白酶体相关基因的表达水平较高。最终,通过比较不同品种不同温度下的转录组数据,得到响应储藏期低温胁迫的候选基因***.02F_G010830,该基因注释为冷胁迫响应类受体蛋白激酶。qRT-PCR验证该基因的表达与转录组数据相一致。进一步分析了该基因及其等位基因和同源基因的进化关系,并分析了该基因在不同品种中的变异。本研究将为甘薯低温储藏响应机制解析以及耐低温储藏品种的选育提供支撑。