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半滑舌鳎dnmt3a基因的分子鉴定和功能研究

作     者:孙衍旭 龚小玲 邵长伟 

作者机构:上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出国家重点实验室 青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 

出 版 物:《上海海洋大学学报》 (Journal of Shanghai Ocean University)

年 卷 期:2024年

核心收录:

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:国家重点研发计划(2022YFD2400100) 中国水产科学研究院基本科研业务费(2024XT0103,2023TD19) 

主  题:半滑舌鳎 dnmt3a基因 DNA甲基化 性别调控 5-Aza-dC 

摘      要:为探究dnmt3a基因在半滑舌鳎性逆转过程中的调控作用,开发适用于半滑舌鳎的DNA甲基化编辑系统,克隆了半滑舌鳎dnmt3a基因的CDS区序列,并通过生物信息学分析其结构域特点以及进化过程中的保守性,利用qPCR分析了其在半滑舌鳎不同性别中的表达模式,探究了DNA甲基化酶抑制剂5-Aza-dC处理对dnmt3a基因表达的影响。结果表明,dnmt3a基因全长3063bp,编码1020个氨基酸,包括三个核心结构域(PWWP结构域、ADDz结构域和AdoMet_MTases超家族),dnmt3a基因结合结构域(PWWP结构域、ADDz结构域)相对保守,催化活性结构域(AdoMet_MTases超家族)与哺乳动物和爬行动物有较大差异。基因表达模式分析表明,雌性半滑舌鳎性腺组织dnmt3a基因表达量显著高于雄性和伪雄性。5-Aza-dC处理后,dnmt3a基因表达显著升高。本研究表明dnmt3a基因在DNA 甲基化调控半滑舌鳎性别决定与分化过程中发挥重要作用,为阐明半滑舌鳎性逆转机制和实现半滑舌鳎单基因靶向DNA 甲基化编辑提供参考。

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