菊花CmOMT基因家族的鉴定及分析

作     者：杨丹 陈竹荫 陈莎 王智民 朱晶晶 

作者机构：中国中医科学院中药研究所 

出 版 物：《中国中药杂志》 (China Journal of Chinese Materia Medica)

年 卷 期：2024年第19期

页      面：5166-5180页

核心收录：

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：中国中医科学院科技创新工程项目(CI2021A04006) 国家自然科学基金项目(81573600) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ZXKT22021) 

主　　题：菊花 氧甲基转移酶(OMT) 生物信息学 功能分析 基因家族 甲氧基黄酮 

摘      要：菊花富含羟基黄酮和甲氧基黄酮，由于甲氧基黄酮具有更好的生理活性和药理作用，因此菊花中甲氧基黄酮(OMFs)的生物合成途径解析具有重要的理论和经济价值。为了更好地促进菊花OMFs生物合成途径的解析，该研究基于菊花全基因组数据，采用生物信息学的方法对菊花CmOMT基因家族进行了系统分析。结果表明从菊花基因组数据库中共鉴定出123个CmOMT基因，编码112～541个氨基酸，等电点为4.92～7.59,相对分子质量为12 651.69～61 300.23,除CmOMT50外，其余122个蛋白均表现为酸性且其中79个蛋白为亲水蛋白。CmOMT基因主要分布在细胞质且定位分布并不均匀。KEGG分析共富集到7个通路，包括新陈代谢、苯丙素类生物合成、类异黄酮生物合成等；基因本体(GO)富集结果显示，123个CmOMT基因共注释到42个类别，分子功能主要包括O-甲基转移酶活性、S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶活性等，生物过程主要包括甲基化、类黄酮代谢过程等。通过启动子分析预测，菊花CmOMT家族能响应光、干旱、低温、茉莉酸甲酯、脱落酸等多种胁迫，并有参与类黄酮生物合成基因调控的MYB结合位点。通过对菊花CmOMT基因家族的分析，为菊花OMFs的生物合成途径解析和后续候选基因的挖掘及功能验证提供了参考。