锦鲤sox10b克隆及生物信息学分析

作     者：魏佳豪 田雪 朱文锦 李泓 Wei Jiahao;Tian Xue;Zhu Wenjin;Li Hong

作者机构：河南师范大学水产学院河南新乡453007 河南省水产科学研究院郑州450044 

出 版 物：《河南水产》 (HENAN FISHERIES)

年 卷 期：2024年第2期

页      面：32-36页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：河南省农业科学院自主创新项目(2023ZC110) 河南省高等学校重点科研项目(22A240001) 河南优势特色农业产业科技支撑行动计划-锦鲤提质增效技术与推广(20231001004) 

主　　题：锦鲤 sox10b 生物信息学分析 系统进化 

摘      要：为了研究锦鲤sox10b基因及其氨基酸序列的结构与功能,本文以纯红锦鲤皮肤cDNA为模板,使用RT-PCR技术克隆获得了锦鲤sox10b的编码区序列(CDS),并对其氨基酸序列进行了生物信息学分析。结果表明,锦鲤sox10b CDS区全长1452bp,共编码483个氨基酸。氨基酸序列比对显示锦鲤Sox10b具有保守的Sox_N Superfamily结构域和HMG-box_SoxE Superfamily结构域。系统进化树结果显示锦鲤sox10b与鲤sox10b、斑马鱼的sox10亲缘关系最近,锦鲤sox10b可能行使与斑马鱼sox10相似的功能。