牛Bta-miR-494序列特征及其组织表达分析

作     者：徐俊杰 丁燕玲 李承隆 周小南 苏总华 曲畅 史远刚 康晓龙 XU Junjie;DING Yanling;LI Chenglong;ZHOU Xiaonan;SU Zonghua;QU Chang;SHI Yuangang;KANG Xiaolong

作者机构：宁夏大学动物科技学院宁夏银川750021 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2024年第39卷第3期

页      面：215-223页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32160776) 中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(XAB2022YW11) 现代农业产业技术体系(CARS-36) 

主　　题：牛 Bta-miR-494 功能富集 组织表达 骨骼肌 

摘      要：为探究牛Bta-miR-494的序列特征及其组织表达情况,运用生物信息学方法分析其上游序列的CpG岛、启动子及转录因子特征及其在不同物种间的保守性;之后对牛Bta-miR-494的靶基因进行预测及功能富集分析;最后通过qRT-PCR方法检测其在牛不同组织及不同时期同一组织间的时空表达特征。结果表明,Bta-miR-494在不同物种间高度保守且与山羊亲缘关系最近,其上游不含CpG岛、存在2个转录起始位点;预测靶基因富集分析表明,Bta-miR-494的靶基因显著富集在PI3K-Akt、p53及MAPK等与肌肉生长发育及代谢相关的信号通路;qRT-PCR结果显示,Bta-miR-494在成年牛肝脏中的表达量最高,睾丸中表达量最低;且Bta-miR-494在成年牛股二头肌中的表达量显著高于初生犊牛,而心肌和背最长肌中的表达量显著低于初生犊牛。这种组织间差异性表达提示,Bta-miR-494可能在牛不同生长阶段的肌肉组织发育过程中主导不同的生肌表达模式。