基于RNA-seq不明原因复发性流产绒毛组织mRNA基因差异性表达研究

作     者：杨丽 杨静 叶尔登切切克 韩锐 腊晓琳 YANG Li;YANG Jing;Yeerdengqieqieke;HAN Rui;LA Xiao-lin

作者机构：新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心乌鲁木齐830054 新疆医科大学第一附属医院生殖疾病与出生缺陷综合防治研究中心乌鲁木齐830054 新疆医科大学第一附属医院新疆生殖免疫临床医学研究中心乌鲁木齐830054 新疆医科大学第一附属医院省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室乌鲁木齐830054 新疆医科大学第五附属医院妇科 

出 版 物：《国际妇产科学杂志》 (Journal of International Obstetrics and Gynecology)

年 卷 期：2024年第51卷第3期

页      面：322-328,341页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100211[医学-妇产科学] 10[医学] 

基　　金：新疆维吾尔自治区自然科学基金(2022D01C467) 省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室开放课题(SKL-HIDCA-2020-JZ11) 

主　　题：流产,习惯性 绒毛组织 RNA,信使 转录组测序 免疫调节 

摘      要：目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例URSA(试验组)和4例选择性终止妊娠孕妇(对照组)的绒毛组织样本。应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选2组差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO功能注释、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,进一步研究差异表达mRNA的功能,并筛选出URSA的关键基因。结果:RNA-seq分析共筛选出3350个DEGs,其中上调基因2259个,下调基因1091个。通过PPI网络分析,筛选出与URSA有关的前10个关键基因:TYROBP、CD74、GH1、GH2、STAT5A、HLA-DRA、STAT5B、HLA-DRB1、CISH和HLA-A。通过GO和KEGG生物学功能分析,发现差异性表达的mRNA参与到多种白细胞分化相关免疫反应通路和同种异体免疫应答等生物学过程。结论:利用RNA-seq获得的URSA的mRNA差异性表达谱,筛选出可能与URSA有关的关键基因及生物学通路,为进一步研究URSA的发病机制和诊疗靶点提供了理论依据。