基于线粒体D-loop序列的江苏克氏原螯虾养殖群体遗传多样性分析

作     者：鲁苏皖 徐宇 李佳佳 高志宝 严维辉 许志强 王兴强 李旭光 Lu Suwan

作者机构：江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏连云港222005 江苏省淡水水产研究所/农业农村部淡水虾蟹遗传育种与养殖重点实验室江苏南京210017 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第52卷第10期

页      面：192-196页

学科分类：090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(编号:JBGS032) 江苏现代农业(克氏原螯虾)产业技术体系建设项目(编号:JATS411) 江苏省农业重大新品种创制项目(编号:PZCZ201746) 

主　　题：克氏原螯虾(Procambarus clarkii) 江苏地区 遗传多样性 遗传结构 

摘      要：江苏是我国克氏原螯虾的主产区,近年来繁养模式不断变化,多代繁养后的遗传多样性变化情况尚未可知,以及江苏地区克氏原螯虾养殖种群的群体遗传学特征数据尚不清楚。为研究当前江苏主产区克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性特征,对来自江苏南京、徐州、连云港、扬州、淮安、无锡、泰州兴化和宿迁泗洪的8个克氏原螯虾养殖群体样本的线粒体控制区D-loop基因片段进行PCR扩增和测序分析,分析了不同养殖群体的遗传结构特点。共测序获得了8个群体223个样本的线粒体D-loop序列,比对长度包括863个位点,其中,变异位点95个,简约信息位点25个。基因序列中AT含量(80.01%)高于CG含量(19.99%),表现出较为明显的碱基组成偏倚性。223个样本共定义了37种单倍型,其中,单倍型Hap 1为8个群体的共有单倍型。泗洪群体独有的单倍型最多,泰州兴化群体独有的单倍型最少。本研究所涉及的养殖群体总体单倍型多样性指数(Hd)为0.39,总体核苷酸多样性指数(Pi)为0.003 37,遗传多样性处于较低水平。其中,宿迁泗洪群体的遗传多样性指数最高(Hd为0.632),兴化群体的遗传多样性指数最低(Hd为0.228)。不同群体间的遗传距离总体较小,其中,南京群体与其他群体间的遗传距离相对较大(0.005),提示南京群体与其他群体间的基因交流较少。8个养殖群体间的遗传分化系数为-0.219 6~0.317 33,徐州、扬州、无锡及连云港群体间的遗传分化系数为负值,表明这些群体间存在较为频繁的基因交流。分子方差分析(A-MOVA)结果显示,95.35%的遗传变异来自于群体内,群体间的遗传变异较少(4.65%)。最小跨度网络图和系统发育分析均未显示出单倍型与不同群体的对应关系,提示当前江苏克氏原螯虾养殖群体间的基因交流较为频繁。