一种基于多路纳米孔测序技术的多种血清型沙门菌快速分型方法
A rapid detection method for multiple serotypes of Salmonella based on multiplex nanopore sequencing作者机构：军事科学院军事医学研究院天津市环境与食品安全风险监督技术重点实验室天津300050
出 版 物：《军事医学》 (Military Medical Sciences)
年 卷 期：2024年第48卷第5期
页 面：389-394页
核心收录：
学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
摘 要：目的构建基于多路纳米孔测序技术的本地化沙门菌血清型分型方法,评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响,为多种血清型沙门菌的同时快速分型提供方法。方法首先,利用纳米孔测序技术建立多菌株测序方法。其次,基于沙门菌核心基因组数据库构建本地化沙门菌血清型分型流程。最后评估血清型数量和测序时间对分型结果的影响。结果建立的多种血清型沙门菌分型方法准确率和特异性均可达到100%,且在2 h测序时间内可完成6株以上不同血清型的沙门菌快速准确分型。结论该方法能够同时对多株血清型沙门菌快速分型,有效提高沙门菌血清型的鉴定效率,为环境水体中沙门菌血清型的快速鉴定提供有力支持。
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