甜瓜PP2C基因家族的鉴定和生物信息学分析

作     者：韩子超 张月洋 刘成功 李壑 苏婷婷 祝建波 Han Zichao;Zhang Yueyang;Liu Chenggong;Li He;Su Tingting;Zhu Jianbo

作者机构：石河子大学生命科学学院石河子832003 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第13期

页      面：4222-4232页

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：兵团重点项目优质耐贮运哈密瓜品系的研究与生产示范(0155/KZ0118)资助 

主　　题：甜瓜 PP2C 基因家族 生物信息学 表达分析 

摘      要：PP2C是一类对生物体具有重要调控作用的蛋白磷酸酶。为研究其在甜瓜生长发育过程中的功能,本研究利用生物信息学方法对甜瓜中PP2C基因家族进行了分析。结果表明,在甜瓜基因组中共包含有61个PP2C基因家族成员,分为11个亚族。motif和基因结构分析结果显示在同一亚家族内,CmPP2C基因的基因结构与motif具有较高的相似性。基因复制事件分析结果表明,片段重复事件是CmPP2C基因家族扩张的主要原因,且CmPP2C基因成员在进化过程中可能经历了严格的纯化选择。表达分析结果显示CmPP2C基因在甜瓜不同组织内呈不均匀分布,有些基因表现出显著的组织特异性。此外,启动子分析结果表明在CmPP2C基因启动子序列中分布有多个植物激素和逆境相关的响应元件。本研究为甜瓜PP2C基因家族生物学功能的研究提供一定的参考。