基因分型方法在结核分枝杆菌分型中的应用进展

作     者：方梓昊 赵文丽 徐雁南 郑佳雄 纪丽微 刘苏洋 林健雄 常巧呈 

作者机构：汕头大学公共卫生学院广东汕头515063 汕头市结核病防治所 

出 版 物：《山东医药》 (Shandong Medical Journal)

年 卷 期：2024年第64卷第15期

页      面：103-107页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

主　　题：结核分枝杆菌分型 基因分型 IS6110限制性片段长度多态性分型 间隔区寡核苷酸分型 长序列多态性分型 可变数目串联重复序列分型 单核苷酸多态性分型 

摘      要：结核分枝杆菌(Mtb)基因分型在结核病流行病学研究中应用广泛,对结核病疫情的监测、溯源和防控具有重要意义。Mtb基因分型方法中,IS6110限制性片段长度多态性分型曾经是国际公认的Mtb分型的“金标准,但其缺陷明显,包括分型能力不足、对样本质量要求高和实验操作繁琐等;间隔区寡核苷酸分型技术操作简便且成本较低,稳定性较高,但其分型能力同样不足,结果可能趋向同型化;长序列多态性分型可以简便、快速鉴别牛型、人型和北京基因型菌株,并且在遗传进化研究中发挥重要作用;可变数目串联重复序列分型的分辨率高、可重复性好,可以根据不同情况优化位点组合,已经成为结核分子流行病学研究的重要方法;单核苷酸多态性分型具有高通量、高分辨率和结果准确性高等优点,在结核分子流行病学上的应用非常广泛,有望成为Mtb分型的下一个金标准。