铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族鉴定及表达模式分析

作     者：李亚萍 金福来 黄宗贵 张涛 段晓婧 姜武 陶正明 陈家栋 LI Yaping;JIN Fulai;HUANG Zonggui;ZHANG Tao;DUAN Xiaojing;JIANG Wu;TAO Zhengming;CHEN Jiadong

作者机构：浙江省亚热带作物研究所浙江温州325005 温州市金福来农业科技有限公司浙江温州325005 温州市种子站浙江温州325052 温州市农业技术推广中心浙江温州325052 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2024年第36卷第4期

页      面：790-799页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(32102485) 温州市农业新品种选育协作组项目(2019ZX003-4) 温州市农业高新园区开放性项目(KN20210005) 温州市科技特派员专项项目(X20210018) 乐清市农业重点科技项目(2022N026,2022N046) 温州市科协服务科技创新项目(kjfw73) 

主　　题：铁皮石斛 糖苷水解酶GH3 生物信息学分析 基因表达模式 

摘      要：利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定,对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析,同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达模式。在铁皮石斛全基因组中筛选得到13个GH3家族基因,其中一个基因存在可变剪切,表达为14个GH3蛋白。GH3基因家族蛋白可分为3个亚家族,各亚家族中不同基因相对保守;各成员均含有内含子与外显子,内含子相位在0~2,13个基因分布在8染色体上。GH3基因家族在铁皮石斛的8个组织中均有表达,其中白根和花蕾表达量高,茎和唇瓣低,推测GH3基因家族可能参与铁皮石斛根系生长以及开花现蕾。低磷与正常磷水平表达结果表明,低磷水平下叶中基因LOC 110110392、LOC 110100144表达上调,根中基因LOC 110095762、LOC 110107269表达上调。该研究对铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族成员生物信息学、在不同组织以及正常磷与低磷条件下的表达水平进行研究分析,筛选响应低磷信号的糖苷水解酶基因,为后期研究糖苷水解酶参与低磷条件下铁皮石斛多糖代谢调节机制提供研究基础。