山东、广西地区新型鹅细小病毒全基因组扩增及遗传进化分析

作     者：乔丹丹 刘婷隽 陈全刚 李德宝 周婕 董淑红 胡安康 QIAO Dandan;LIU Tingjun;CHEN Quangang;LI Debao;ZHOU Jie;DONG Shuhong;HU Ankang

作者机构：徐州医科大学实验动物中心江苏徐州221004 徐州生物工程职业技术学院动物工程学院江苏徐州221006 

出 版 物：《中国家禽》 (China Poultry)

年 卷 期：2024年第46卷第6期

页      面：44-55页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：徐州市科技创新重点研发计划-面上项目(KC22078) 徐州市科技局社会发展项目(KC21258) 

主　　题：新型鹅细小病毒 全基因组序列 鸭 变异 

摘      要：为监测新型鹅细小病毒(Novel goose parvovirus,NGPV)的流行和变异情况,研究采集了山东和广西部分地区的鸭短喙综合征病料进行病原检测、全基因组扩增及序列比对分析。结果显示:共分离两株NGPV,山东分离株命名为SD202304,广西分离株命名为GX202304,两株病毒与2021年NGPV分离株HNXY21亲缘关系最近,全基因组序列相似性为99.1%;GX202304株末端重复序列(Inverted terminal repeat,ITR)有一段未见报道的51 bp基因插入;VP3编码氨基酸序列比对显示,在第290位GX202304株和SD202304株有一个苏氨酸到丙氨酸的突变,这是NGPV近年来发生的新变异位点。研究表明,从山东、广西地区分离到的两株NGPV存在51 bp新的基因插入片段和VP3新的突变位点,结果为我国NGPV感染的防控提供科学依据。