基于SSR标记的文冠果遗传多样性分析及指纹图谱构建

作     者：李思琪 张文臣 杨柳 付庆新 洪新 张海旺 LI Si-qi;ZHANG Wen-chen;YANG Liu;FU Qing-xin;HONG Xin;ZHANG Hai-wang

作者机构：辽宁省旱地农林研究所朝阳122000 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2024年第40卷第5期

页      面：74-83页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 0907[农学-林学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0829[工学-林业工程] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：中央财政林业科技推广示范项目(辽TG 19号) 辽宁省农业科学院旱地特色经济林学科建设计划项目(2019DD206530) 辽宁省林业和草原局依托国家林草局科技创新平台研发项目(LLC21) 

主　　题：文冠果 品种(系) SSR荧光标记 遗传多样性 指纹图谱 分子身份证 聚类分析 

摘      要：【目的】为快速鉴定和利用文冠果种质资源,探明文冠果种质亲缘关系。【方法】从20对SSR引物筛选得到11对条带清晰、多态性好的引物,对29个文冠果品种(系)进行分析,采用荧光毛细管电泳技术进行多态检测,通过邻接法进行聚类分析,利用数字和字母赋值编码构建分子身份证。【结果】共检测到66个等位基因(Na),每对引物检测到3-10个Na。Shannon信息指数(I)变化范围介于0.349-1.723之间,平均值为1.16。不同引物揭示的多态信息含量(PIC)变幅介于0.276-0.841,平均为0.66。观测杂合度(Ho)变幅为0.137-0.958,平均值为0.739;期望杂合度(He)变幅为0.187-0.79,平均值为0.648;在11个位点中,有7个位点的平均观测杂合度大于平均期望杂合度。遗传相似系数变化范围为0-1,平均为0.31,遗传相似系数在0.6以上的有15个,仅占全部数据的5.17%。邻接法聚类分析结果显示,在遗传距离为0.42时,可将29份文冠果种质分为三大类群。构建了0/1形式的指纹数据库和分子身份证,除个别品种外均具有唯一性,可用于品种鉴定。【结论】29份文冠果种质资源的遗传多样性相对较高,但也存在一定的近交现象。利用SSR标记构建文冠果分子身份证操作简便可行,可为文冠果品种真伪鉴定、权益保护、身份识别、溯源管理及新品种选育提供技术支撑和科学依据。