基于网络药理学和生物信息学探索金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制

作     者：林丽桥 黄敬媚 黄小晓 李政钊 LIN Liqiao;HUANG Jingmei;HUANG Xiaoxiao;LI Zhengzhao

作者机构：广西医科大学第二临床医学院广西南宁530021 广西医科大学第二附属医院急诊科广西南宁530007 

出 版 物：《现代医药卫生》 (Journal of Modern Medicine & Health)

年 卷 期：2024年第40卷第11期

页      面：1814-1822页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：广西自然科学基金青年项目(2022GXNSFAA035459) 

主　　题：肝肿瘤 网络药理学 生物信息学 金雀异黄酮 肝细胞癌 

摘      要：目的通过网络药理学及生物信息学方法阐明金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制。方法利用网络药理学、生物信息学和实验验证方法。从Pharm Mapper数据库获取金雀异黄酮的潜在作用靶点。使用Gene Cards数据库获取肝细胞癌的致病基因,分析确定金雀异黄酮潜在靶点与肝细胞癌相关靶点的交集基因。采用TCGA的肝细胞癌组织样本和正常组织样本的RNA测序数据及临床信息,筛选出差异表达的共同靶基因,并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过单因素Cox分析筛选影响患者总体生存期的差异表达基因(DEGs),利用STRING平台构建DEGs的靶点交互网络,并筛选核心基因进行验证。进行分子对接试验,检测金雀异黄酮对肝细胞癌增殖的影响。结果共筛选出235个金雀异黄酮的潜在作用靶点和9415个肝细胞癌的治疗靶点,其中40个差异表达的共同靶基因影响患者的预后。其中,ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4为核心靶点。GO功能注释富集分析获得333个富集项,KEGG通路富集分析获得23个富集结果。分子对接结果显示,金雀异黄酮与核心靶蛋白有强烈的结合能力。体外实验证实,金雀异黄酮显著抑制了肝细胞癌的增殖。结论金雀异黄酮通过多个代谢和信号通路抑制肝细胞癌的发展机制。ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4的表达水平可用于预测肝细胞癌患者的预后,为治疗提供有价值的靶点。