彩色小麦株高与籽粒性状的全基因组关联分析

作     者：李浩阳 顾晶晶 赵文莎 宋鹏博 赵慧玲 张傲琰 张传量 王琪琳 孙道杰 LI Haoyang;GU Jingjing;ZHAO Wensha;SONG Pengbo;ZHAO Huiling;ZHANG Aoyan;ZHANG Chuanliang;WANG Qilin;SUN Daojie

作者机构：西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100 洛阳市农林科学院河南洛阳471000 陕西九丰农业科技有限公司陕西宝鸡722299 

出 版 物：《麦类作物学报》 (Journal of Triticeae Crops)

年 卷 期：2024年第44卷第6期

页      面：718-728页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2016YFD0101802)。 

主　　题：彩色小麦 株高 籽粒性状 GWAS SNP 

摘      要：彩色小麦的产量通常低于普通白粒和红粒小麦,籽粒偏小是原因之一。为解析控制彩色小麦产量性状的遗传基础,分析了239份彩色小麦品种(系)在4个环境下的表型特性和16 K SNP芯片基因型数据,对株高和籽粒性状(千粒重、籽粒长、籽粒宽和籽粒长宽比)的QTL进行了全基因组关联分析(genome-wide-association-study,GWAS)。结果显示,各表型性状的变异系数为5.11%~32.91%,广义遗传力为71.88%~97.00%,多数性状之间具有显著相关性。通过GWAS共筛选出26728个多态性SNP标记,定位到了17个与目标性状显著相关的稳定QTL位点,分布在1A、1B、1D、2B等12条染色体上,单个QTL解释5.26%~11.66%的表型变异,其中在3个环境下均被检测到的QTL有5个,分别为QPh.nwafu-4B.1、QKlwr.nwafu-1D、QKlwr.nwafu-4D、QKlwr.nwafu-5B.1和QKlwr.nwafu-6A.2;共发现10个未见报道的新QTL位点,分别为与株高相关的QPh.nwafu-4B.3,与千粒重相关的QTkw.nwafu-3B和QTkw.nwafu-6A,与籽粒长宽比相关的QKlwr.nwafu-1A、QKlwr.nwafu-1B、QKlwr.nwafu-4A、QKlwr.nwafu-5B.2、QKlwr.nwafu-6A.1和QKlwr.nwafu-6A.2。这些QTL位点初步表明了彩色小麦株高与籽粒性状基因位点的分布、组成,可为彩色小麦产量遗传改良提高参考。