舌黏膜癌变基因组甲基化分析

作     者：刘华 岳万远 邵帅 孙家平 杨莹 代晓明 Liu Hua;Yue Wanyuan;Shao Shuai;Sun Jiaping;Yang Ying;Dai Xiaoming

作者机构：云南大学附属医院口腔颌面外科昆明650021 昆明医科大学第一附属医院病理科昆明650031 昆明医科大学第一附属医院整形外科颌面组昆明650031 

出 版 物：《华西口腔医学杂志》 (West China Journal of Stomatology)

年 卷 期：2024年第42卷第3期

页      面：319-328页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：云南省科技厅-昆医联合专项[202001AY070001-253 2018FE001(-216)] 

主　　题：舌癌 发病机制 甲基化 动物模型 甲基化DNA免疫沉淀测序 差异表达基因 

摘      要：目的研究舌黏膜癌变过程中基因组甲基化特征,探讨舌癌中DNA甲基化的规律。方法用50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水诱导C57BL/6J小鼠舌黏膜癌变,分别取第0、12、28周的舌黏膜(分别代表正常、癌前病变和癌变)进行基因芯片检测和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq),在人舌黏膜组织和人舌癌细胞系中,用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和飞行质谱检测验证转化生长因子贝塔信号蛋白1(SMAD1)的表达和启动子的甲基化。结果28周较12周和0周舌黏膜的胞嘧啶鸟嘌呤岛(CGI)甲基化水平均升高,12周时启动子甲基化水平高于0周。在0、12和28周期间,208个差异表达基因与启动子中的差异甲基化呈负相关。与正常黏膜相比,细胞系中SMAD1的mRNA上调,同时启动子甲基化水平降低。结论舌黏膜癌变中伴随DNA甲基化修饰异常,舌癌中SMAD1高表达伴启动子低甲基化。