基于生物信息学分析CCND2在甲状腺乳头状癌中的表达及其对免疫浸润的影响

作     者：王沁智 宋冰 郝诗睿 肖志远 金连辉 郑通 柴芳 WANG Qinzhi;SONG Bing;HAO Shirui;XIAO Zhiyuan;JIN Lianhui;ZHENG Tong;CHAI Fang

作者机构：锦州医科大学附属第一医院甲状腺外科辽宁锦州121001 锦州医科大学附属第一医院内分泌与代谢性疾病科辽宁锦州121001 锦州医科大学附属第一医院麻醉科辽宁锦州121001 衡水市人民医院河北衡水053000 营口市人民医院辽宁营口115000 

出 版 物：《南方医科大学学报》 (Journal of Southern Medical University)

年 卷 期：2024年第44卷第5期

页      面：981-988页

核心收录：

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 0711[理学-系统科学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 08[工学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：辽宁省科技厅自然科学基金(2021-MS-333) 

主　　题：甲状腺乳头状癌 细胞周期蛋白D2 生物信息学 肿瘤免疫浸润 

摘      要：目的探讨凋亡相关基因细胞周期蛋白D2(CCND2)在甲状腺乳头状癌中的表达及其与临床病理的联系。方法通过公共数据库TCGA、TIMER 2.0和UALCAN获取CCND2的表达情况;采用ROC曲线对甲状腺乳头状癌(PTC)组织和癌旁组织进行鉴别;使用基因本体功能注释(GO)对CCND2相关差异基因(DEGs)进行富集分析;使用TIMER数据库和CIBERSORT数据源分析甲状腺癌中CCND2的肿瘤免疫浸润情况;采用RT-qPCR和Western blot检测人甲状腺正常细胞系Nthy-ori-3-1和人甲状腺乳头状癌细胞系TPC-1、BCPAP中CCND2表达量;采用免疫组织化学SABC法检测PTC及癌旁组织中CCND2表达,并探讨其与临床病理的联系。结果TCGA、TIMER2.0、UALCAN分析显示,与癌旁组织相比,CCND2 mRNA在甲状腺癌中高表达(P0,P0.001),而与CD8^(+)T细胞呈负相关(***0,P0.01)。CIBERSORT数据库显示,CCND2表达与B细胞记忆渗透水平、CD4^(+)T细胞记忆激活状态、M2巨噬细胞表达水平、肥大细胞静息状态和肥大细胞激活状态显著相关(P0.05)。RT-qPCR及Western blot结果显示,CCND2在细胞系TPC-1、BCPAP中的表达量高于Nthy-ori-3-1(P0.01)。免疫组织化学结果显示,CCND2在PTC中的阳性表达高于癌旁组织(P0.05)且与肿瘤大小、淋巴结转移及TNM分期相关(P0.05)。结论PTC中CCND2表达上调可能与肿瘤进展及免疫细胞浸润密切相关。