玉米蚜线粒体基因组测序及蚜族系统发育分析

作     者：林兴雨 任凯杰 宋凡 宋南 李虎 LIN Xingyu;REN Kaijie;SONG Fan;SONG Nan;LI Hu

作者机构：河南农业大学植物保护学院郑州450046 中国农业大学植物保护学院北京100193 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2024年第43卷第4期

页      面：675-684页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(U1904104)资助。 

主　　题：玉米蚜 缢管蚜属 蚜族 线粒体基因组 系统发育 

摘      要：为探究玉米蚜(Rhopalosiphum maidis)线粒体基因组结构特征及蚜族(Aphidini)的系统发育关系,本研究利用高通量测序技术测定了玉米蚜线粒体基因组全序列。选择已知的蚜族18个物种线粒体基因组作为内群,选择长管蚜族(Macrosiphini)2个物种线粒体基因组作为外群,利用最大似然法(maximum likelihood method)和贝叶斯法(Bayesian inference method)重建蚜族的系统发育关系。玉米蚜的线粒体基因组全长为15096 bp,呈环状,包括13个蛋白质编码基因(protein-coding genes)、22个tRNA基因和2个rRNA基因,还有一段非编码控制区。13个蛋白质编码基因的起始密码子全为ATN;3个蛋白质编码基因cox1、nad4和nad5具有不完整的终止密码子T或TA,其余10个蛋白质编码基因为完整的终止密码子TAA或TAG。本研究利用线粒体基因组数据重建了蚜族的系统发育关系,最大似然法和贝叶斯法构建的蚜族的系统发育关系是基本一致的。其中,色蚜属(Melanaphis)、桃粉蚜属(Hyalopterus)、蚜属(Aphis)为单系群,缢管蚜属(Rhopalosiphum)为非单系群。