线粒体相关基因在特发性肺纤维化中的分析

作     者：吴沛玲 娄月妍 张洪艳 陈东方 刘雪青 赵丽芳 薛姗 蒋捍东 Wu Peiling;Lou Yueyan;Zhang Hongyan;Chen Dongfang;Xue Shan;Zhao Lifang;Liu Xueqing;Jiang Handong

作者机构：上海交通大学医学院附属仁济医院呼吸与危重症医学科上海200120 

出 版 物：《中华肺部疾病杂志（电子版）》 (Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition))

年 卷 期：2024年第17卷第2期

页      面：178-184页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目资助(82173828) 

主　　题：特发性肺纤维化 线粒体 免疫 生物信息学 

摘      要：目的通过生物信息学方法和肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)小鼠模型分析与特发性肺纤维化发生发展相关的线粒体相关基因。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibu,GEO)中获得IPF样本和正常样本间的差异表达基因;通过MitoCarta3.0数据库和所得差异基因进行匹配,以获取线粒体相关差异基因(mitochondrial-related differential expressed genes,MiRDEGs),并对其进行基因本体论(GeneOntology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析;构建MiRDEGs的PPI网络,并使用Cytohubba获得核心MiRDEGs;建立肺纤维化小鼠模型验证鉴定出的核心MiRDEGs。结果最终得到26个上调的MiRDEGs和24个下调的MiRDEGs,主要涉及到有氧呼吸,线粒体结构和物质代谢。其中10个MiRDEGs被cytohubba鉴定为核心MiRDEGs。结果表明,在小鼠肺纤维化模型中,FASN,PDK4,ACSL1的表达低于对照组,而ALDH18A1,MTHFD2,ALDH1L2,PC的表达则高于对照组。结论IPF中的线粒体相关基因及其对免疫浸润的影响与IPF的发病相关并可能为潜在的治疗靶点。