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单细胞分选与测序技术在环境微生物领域的应用及前景

Application and prospect of single-cell isolation and sequencing technology in environmental microbiology

作     者:郭晗玥 王礼岳 阮杨 徐琪程 凌宁 沈其荣 GUO Hanyue;WANG Liyue;RUAN Yang;XU Qicheng;LING Ning;SHEN Qirong

作者机构:南京农业大学资源与环境科学学院/江苏省固体有机废弃物资源化高新技术研究重点实验室江苏南京210095 

出 版 物:《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期:2024年第47卷第3期

页      面:415-423页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金项目(42307174) 

主  题:单细胞分选 单细胞测序 单细胞基因组 环境微生物 

摘      要:随着对环境微生物生态系统认知的深化,对其深入研究的需求持续增加,传统的培养组学和环境DNA测序等研究手段已经难以满足对微生物物种和功能多样性的全面了解。单细胞分选与测序技术为环境微生物研究开创了全新的视角,成为该领域的热点与前沿。单细胞技术将微生物研究的焦点从群落水平深入到个体细胞层面,通过精准分选并测序单个微生物细胞,深入挖掘微生物的种间和种内多样性以及功能特性。本综述介绍单细胞技术在环境微生物研究中的应用,详细论述单细胞分选和基因组扩增的关键过程,并探讨单细胞测序数据解析过程中的生物信息学基本流程,为单细胞分选与测序技术在环境微生物研究中的发展提供借鉴和启示。

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