高粱CIPK家族基因的全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达特征

作     者：徐鹏 李春宏 范昕琦 梁笃 沈新莲 XU Peng;LI Chun-hong;FAN Xin-qi;LIANG Du;SHEN Xin-lian

作者机构：江苏省农业科学院经济作物研究所/农业农村部长江下游棉花与油菜重点实验室江苏南京210014 山西农业大学农学院山西晋中030801 山西省农业科学院高粱研究所/高粱遗传与种质创新山西省重点实验室山西晋中030600 

出 版 物：《江苏农业学报》 (Jiangsu Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第40卷第4期

页      面：591-598页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：亚夫科技服务项目[KF(21)3001] 山西省基础研究计划项目(202103021223130) 山西种业创新良种联合攻关项目(2022N2GL-06) 山西省农业科学院杂粮分子育种平台专项(YGC2019FZ5) 山西省科技合作交流专项(202204041101032)。 

主　　题：高粱 CIPK基因 全基因组鉴定 非生物胁迫 

摘      要：钙调磷酸酶B样蛋白互作蛋白激酶(CIPK)是一种重要的Ca^(2+)信号传感器,在植物应答逆境非生物胁迫过程中发挥着重要作用。为了探究高粱中CIPK家族基因的功能,本研究从高粱基因组中鉴定了31个SbCIPK基因,这些基因不均匀地分布在高粱的9条染色体上,编码蛋白质的氨基酸数量为403~519个,等电点为6.07~9.38,相对分子质量为46 357.31~58 316.97。基因结构分析结果表明,SbCIPK家族基因分为内含子缺失型和内含子富集型2类。进化树分析结果表明,SbCIPK家族蛋白质成员分为8个亚族。基于转录组数据的表达模式分析结果表明,SbCIPK基因广泛参与对盐胁迫、干旱胁迫等非生物胁迫的响应。本研究结果可以为高粱CIPK家族基因的功能研究奠定基础。