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数据非依赖采集张量质谱数据计算平台的开发

Development of a Computing Platform for Data Independent Acquisition Tensor Data

作     者:周海洋 刘朋欢 金尚忠 ZHOU Hai-yang;LIU Peng-huan;JIN Shang-zhong

作者机构:中国计量大学光学与电子科技学院浙江杭州310000 

出 版 物:《质谱学报》 (Journal of Chinese Mass Spectrometry Society)

年 卷 期:2024年第45卷第3期

页      面:412-421,I0005页

核心收录:

学科分类:081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070302[理学-分析化学] 0703[理学-化学] 0835[工学-软件工程] 081202[工学-计算机软件与理论] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)] 

基  金:国家重点研发计划(2022YFF0608404) 

主  题:质谱 数据非依赖采集(DIA) 图形化用户交互界面(GUI) 深度学习 视觉变换网络 

摘      要:数据非依赖采集张量(data independent acquisition tensor,DIAT)是一种质谱数据格式,用于处理和分析数据非依赖采集方法获得的蛋白质组学数据。与传统方法相比,DIAT技术具有便捷的数据可视化处理和高效的深度学习模型训练等优势。但由于目前缺乏支持DIAT格式数据的软件平台,限制了其应用。为解决这一问题,本文基于PyQt框架设计了一款用于处理和分析DIAT数据的软件,涵盖了与DIAT技术相关的所有功能,使用户能够轻松地利用DIAT数据进行复杂分析,降低了使用门槛,为数据非依赖采集(DIA)质谱数据分析注入了活力。

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