水稻Dof家族的全基因组鉴定及干旱处理表达模式分析
作者机构:江西省农业科学院水稻研究所水稻国家工程研究中心(南昌) 江西农业大学农学院
出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)
年 卷 期:2024年
基 金:江西省农业科学院博士启动基金项目(JXSNKYJCRC202318)资助
摘 要:Dof家族作为植物中一种特有的转录因子,在植物生长发育、光形态建成以及逆境响应等生物学过程中具有非常重要的作用。本研究从水稻基因组中鉴定出30个Dof基因家族成员,进行了系统的生物信息学和干旱处理下的表达模式分析。Dof家族成员在不同的染色体上分布不均匀,在11号染色体无成员分布。氨基酸序列比对分析发现,Dof蛋白主要含有3种Motif类型。组织表达模式分析表明,几乎所有的OsDofs都具有较强的组织特异性表达模式,在不同组织、不同时期表达存在差异。顺式作用元件的预测结果表明,OsDofs含有不同比例的植物生长、非生物胁迫、植物激素和光响应元件。所有OsDofs均表现出对干旱胁迫不同程度的响应。本研究表明水稻Dof蛋白序列具有相似性和保守性,基因表达水平以及调控模式多样化,可为进一步研究水稻Dof家族的功能提供理论基础。