连翘多胺氧化酶基因家族的鉴定及干旱和盐胁迫下的表达分析
Identification and expression analysis of Forsythia suspensa PAO gene family under salt and drought stress作者机构:河南科技大学农学院河南洛阳471023 河南省药食兼用资源评价与创新利用工程研究中心河南洛阳471023
出 版 物:《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)
年 卷 期:2024年第55卷第9期
页 面:3077-3084页
核心收录:
学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金项目(U1404829) 中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302) 河南省自然科学基金资助项目(202102110156) 河南省科技攻关(242102110325) 河南省中药材产业科技特派员服务团、河南省中药产业技术体系建设专项资金资助
主 题:连翘 PAO基因家族 基因表达 胁迫 蛋白质结构分析
摘 要:目的研究连翘多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)基因家族在盐和干旱胁迫下的响应特征。方法通过分析连翘转录组数据鉴定出5个连翘PAO基因家族成员,结合蛋白质理化性质和基序分析、蛋白质结构分析、系统进化分析、结构域等方式进行相关性分析,并探究了盐和干旱胁迫下PAO基因的表达水平。结果连翘PAO基因家族氨基酸数介于235~541 aa,相对分子质量在26069~59328,等电点在5.27~5.86;不稳定系数为35.68~44.14,总平均亲水性皆为负值,推测连翘PAO家族蛋白均为不稳定型、酸性、亲水性蛋白,α-螺旋与无规则卷曲为蛋白主要二级结构形式。结论鉴定出的5个连翘PAO基因家族成员均具有特异性表达模式;在盐和干旱胁迫下5个连翘PAO基因家族成员的表达均受到诱导,可能参与连翘的盐胁迫及干旱胁迫响应调控,为深入探讨连翘PAO基因家族的功能奠定了基础。