草鱼肠道微生物谱及其发育性变化

作     者：张红芳 钱涛 金婷 谢小玲 吴酬飞 肖英平 马灵燕 ZHANG Hongfang;QIAN Tao;JIN Ting;XIE Xiaoling;WU Choufei;XIAO Yingping;MA Lingyan

作者机构：湖州师范学院生命科学学院浙江湖州313000 浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所省部共建农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室浙江杭州310021 开化县农业农村局浙江开化324300 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2024年第36卷第4期

页      面：780-789页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：农产品标准化生产示范县建设(“一县一品一策”)重大专项(ZJNY2022001-007) 

主　　题：草鱼 肠道菌群 发育性变化 

摘      要：为了研究草鱼不同肠段微生物结构以及草鱼不同发育阶段肠道菌群的分布和变化。试验分2个部分进行,第一部分:试验选取24月龄生理状况良好的草鱼8尾,用MS-222对其深度麻醉,收集草鱼前肠、中肠、后肠段内容物进行DNA提取和16S rRNA基因测序;第二部分:从浙江省衢州市开化县一典型的开化清水鱼养殖基地购买不同月龄(1、7、15、24月龄)的健康草鱼各25尾,为了保证足够的样本量和最大限度降低个体差异,每5尾鱼的后肠段内容物混合为一个样本。用16S rRNA基因高通量测序方法,分析不同月龄草鱼肠道菌群的分布和变化。结果显示:(1)Alpha多样性表明,草鱼的后肠段微生物群落多样性和丰富度显著高于前肠和中肠段(P0.05);Beta多样性表明,后肠段的微生物群落与前肠段和中肠段存在显著差异(P0.05)。(2)热图(Heatmap)显示,罗斯氏菌属(Ralstonia)是前肠段的主要优势菌属;砷氧化菌(Aliihoeflea)是中肠段的主要优势菌属;纤发鞘丝蓝细菌属(Leptolyngbya)和鲸杆菌属(Cetobacterium)是后肠段的主要优势菌属。(3)从1到24月龄,草鱼后肠段微生物群落多样性和丰富度显著降低(P0.05);Beta多样性表明,不同月龄的草鱼后肠段微生物结构存在显著差异(P0.05)。(4)热图(Heatmap)显示,Rubellimicrobium和Synechococcus是1月龄后肠段的主要优势菌属;Aestuariimicrobium和Streptomyces是7月龄后肠段的主要优势菌属;Kineosporia和Prevotella是15月龄后肠段的主要优势菌属;Mesonia是24月龄后肠段的主要优势菌属。这表明不同肠段的草鱼微生物组成和结构存在差异,以及草鱼肠道微生物结构在生长的不同阶段呈发育性变化。