妊娠期高血压患者胎盘组织中circRNA 表达差异及其潜在作用机制

作     者：吕俊刚 翟莉 刘金龙 张琳 王娜 逄瑷博 闫志风 LV Jungang;ZHAI Li;LIU Jinlong;ZHANG Lin;WANG Na;PANG Aibo;YAN Zhifeng

作者机构：武警北京总队医院内三科100027 解放军总医院第一医学中心妇产科北京100853 武警特色医学中心妇产科天津300162 解放军医学院北京100853 

出 版 物：《武警医学》 (Medical Journal of the Chinese People's Armed Police Force)

年 卷 期：2024年第35卷第4期

页      面：329-334页

学科分类：1005[医学-中医学] 100512[医学-针灸推拿学] 10[医学] 

主　　题：妊娠期高血压 高通量测序 circRNA 胎盘 

摘      要：目的基于高通量测序检测妊娠期高血压患者与健康产妇胎盘中环状RNA(circRNA)表达差异,探讨妊娠期高血压发病机制。方法选取某三甲医院2018-02至2018-12期间收治的6例患有妊娠期高血压的产妇为研究对象(M组),选择同期的6例健康产妇作为对照组(C组)。采用BWA-MEM将妊娠高血压组患者与健康对照组的胎盘组织质控后测序,使用CIRI2对circRNA鉴定,并确定circRNA来源。利用DEGseq进行circRNA差异表达分析。采用miRanda软件和该物种的miRBase序列来预测circRNA的靶标miRNA,再利用Targetscan数据库预测相应的mRNA。将差异circRNA靶基因进行GO和KEGG富集分析,并导入String在线数据库进行聚类分析,寻找处于网络核心的基因。结果两组共有31个circRNA存在差异,14个下调,17个上调,其中前5个上调circRNA分别是circRNA00809、circRNA00593、circRNA00166、circRNA00184、circRNA00028,前5个下调circRNA分别是circRNA00520、circRNA00714、circRNA02491、circRNA00841、circRNA01454。GO富集分析显示,主要富集的生物学过程为生殖过程;主要富集的细胞组分是胞外区;主要富集的分子功能是电子转移活性。KEGG通路富集中,新陈代谢方面涉及的最多。相互作用网络分析可见,NOTCH1/2处于核心位置。结论胎盘组织中31种circRNA的差异表达与妊娠期高血压相关,其可能主要通过调节物质代谢通路发挥作用,同时NOTCH1/2等基因处于调控网络中心。