KIF4A和RAD51AP1及CDKN3对食道癌的辅助诊断及预后评估价值

作     者：邱实 郭春霞 李雷 袁剑锋 刘杰 彭叶叶 邱倩 Qiu Shi;Guo Chunxia;Li Lei;Yuan Jianfeng;Liu Jie;Peng Yeye;Qiu Qian

作者机构：中国人民解放军总医院第七医学中心检验科北京100700 开封市妇幼保健院儿童保健科开封475000 珠海贝索生物技术有限公司珠海519070 中国人民解放军中部战区总医院特勤科武汉430070 重庆市公共卫生医疗救治中心博士后科研工作站重庆400036 

出 版 物：《中华预防医学杂志》 (Chinese Journal of Preventive Medicine)

年 卷 期：2024年第58卷第5期

页      面：665-672页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：重庆市自然科学基金面上项目(cstc2021jcyj-msxmX0449) 中国民族卫生协会临床科研专项(MZXB-GJA-2202) 

主　　题：食道癌 诊断 预后 

摘      要：利用高通量测序数据探讨食道癌(ESCA)组织中的mRNA的表达及其潜在辅助诊断及预后评估价值。通过整合的生物信息学分析方法,收集美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库中173例ESCA患者的基因表达谱及临床数据,利用DESeq2、edgeR和limma分析ESCA组织与癌旁组织样本中的mRNA表达水平的差异,筛选差异表达基因(DEGs);绘制DEGs相关蛋白网络图,对其进行GO和KEGG功能富集分析并筛选枢纽基因,随后对枢纽基因行生存分析,选出与ESCA预后相关的基因并分析其在ESCA中的预后价值;最后绘制受试者工作特征曲线以评价其对ESCA的诊断价值。结果显示,共筛选出在ESCA与癌旁组织之间有显著差异表达的上调DEGs 620个,下调DEGs 668个。DEGs主要参与受体、泛素连接酶等复合物的形成,发挥GTP酶活性、磷脂结合等分子功能,参与调节细胞内物质转运、小分子代谢等生物过程。蛋白功能富集分析显示,这些蛋白主要富集在IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、EB病毒感染、以及中性粒细胞胞外陷阱形成等通路上,参与ESCA的形成和发展过程。生存分析显示,KIF4A、RAD51AP1和CDKN3高表达的ESCA患者总生存率明显缩短(P均0.05);同时,KIF4A、RAD51AP1和CDKN3诊断ESCA的曲线下面积分别为0.956、0.951和0.979,灵敏度和特异度均在80%以上;这三者的联合诊断模型ROC结果显示AUC达到0.979,灵敏度和特异度分别为0.914和1;表明KIF4A、RAD51AP1及CDKN3对ESCA具有单独或联合的辅助诊断价值。综上,KIF4A、RAD51AP1及CDKN3对ESCA具有较高的诊断效能,它们的表达升高与ESCA患者的预后可能密切相关,提示这3个基因有可能作为ESCA的辅助诊断和预后评估因子。