糖尿病肾病核心基因的筛选与鉴定

作     者：吴晓俊 倪飞雪 徐玉雪 Wu Xiaojun;Ni Feixue;Xu Yuxue

作者机构：滨州医学院药学院烟台264003 滨州医学院山东省分子靶向智能诊疗技术创新中心烟台264003 滨州医学院烟台市干细胞与再生医学重点实验室烟台264003 

出 版 物：《安徽医科大学学报》 (Acta Universitatis Medicinalis Anhui)

年 卷 期：2024年第59卷第4期

页      面：610-618页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(编号:31800985) 山东省医药卫生科技发展计划项目(编号:2017WS694) 烟台市科技创新发展计划基础研究类项目(编号:2023JCYJ072) 滨州医学院科研启动基金(编号:BY2017KYQD09) 

主　　题：糖尿病肾病 GEO数据库 转录组 生物信息学 基因筛选 药物靶点 

摘      要：目的基于生物信息学筛选糖尿病肾病(DKD)核心基因,探究DKD的治疗靶点,讨论其可能的调控机制。方法提取GEO数据库(GSE30528,GSE47183)DKD患者肾小球转录组表达数据矩阵,采用生物信息学方法对差异表达基因(DEGs)进行筛选,鉴定出核心差异基因,对核心差异基因进行基因表达与富集分析(GSEA),预测有效靶点。结果通过对DKD mRNA表达矩阵的筛选和鉴定,共筛选出5个核心基因,其中C1orf21、NPHS1表达显著下调,CD48、COL1A2、TGFBI表达上调,研究得知,NPHS1、CD48与免疫差异、细胞间交流及细胞表面相互作用等有显著相关性。通过受试者工作特征曲线(ROC)分析、GSEA分析及药物靶点与miRNA预测显示,这些差异基因可能对DKD的治疗具有重要意义。结论该研究筛选的核心基因与DKD具有显著相关性,有可能作为糖尿病治疗有效标志物,为DKD的治疗与鉴定提供理论依据。