谷子AGO基因家族全基因组鉴定及特征分析

作     者：郭晓燕 宋健 员世宇 王宏丽 杨成元 张鑫 GUO Xiaoyan;SONG Jian;YUN Shiyu;WANG Hongi;YANG Chengyuan;ZHANG Xin

作者机构：山西农业大学经济作物研究所山西太原030031 

出 版 物：《中国草地学报》 (Chinese Journal of Grassland)

年 卷 期：2024年第46卷第4期

页      面：1-10页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：“十四五”生育育种工程项目(YZGC053) 吕梁市重点研发项目(2022NYGG12) 国家重要特色物种谷子育种联合攻关项目(gzlg-05) 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(CARS-06-14.5-B9) 

主　　题：谷子 AGOs 全基因组鉴定 生物信息学分析 

摘      要：阿尔戈蛋白(Argonaute proteins,AGO proteins)作为一种高度保守的RNA诱导沉默复合物,与基因转录和转录后沉默有关。目前,植物AGO基因功能的研究主要集中在拟南芥和水稻,对谷子AGO基因功能尚无文献报道。本研究利用生物信息学方法在谷子全基因组中鉴定出15个具有保守结构域和位置顺序的家族成员,分布在7条染色体上,其编码的蛋白质长度在862~1148 aa之间。系统进化分析显示,谷子AGOs蛋白分布在3个进化分支,与拟南芥相比,家族成员数量有所扩展;组织表达特异性分析表明,谷子AGOs大部分基因在穗部表达强烈,推测其参与生殖发育基因调控;蛋白互作结果预测显示,所有谷子AGOs蛋白都与三种蛋白质相互作用,其中DNA介导的RNA聚合酶v亚单位1已被证明与转录水平基因沉默有关。表明AGO基因在谷子进化过程中结构和功能保守,可为谷子AGO基因家族成员的功能研究提供理论基础。