白纹伊蚊细胞色素P450 CYP4H42v2蛋白生物信息学分析

作     者：黄琳 梁秋果 杨天皓 杨绚 汤红日 龚英 刘晖 莫兴泽 HUANG Lin;LIANG Qiuguo;YANG Tianhao;YANG Xuan;GONG Ying;LIU Hui;MO Xingze

作者机构：黔南民族医学高等专科学校贵州都匀558000 遵义医科大学病原生物学教研室 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2024年第19卷第5期

页      面：544-549,554页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(No.82060374) 贵州省卫生健康委科学技术基金项目(No.gzwkj2023-251,No.gzwkj2022-262) 黔南民族医学高等专科学校校级科研项目(No.QNYZ202031) 黔南民族医学高等专科学校大学生创新创业项目(No.QNYZ202205) 

主　　题：白纹伊蚊 CYP4 序列分析 功能蛋白 

摘      要：目的运用生物信息学方法预测分析白纹伊蚊细胞色素CYP4H42v2蛋白的结构与功能。方法基于白纹伊蚊基因组数据库筛选出CYP4H42v2基因并进行PCR验证;利用在线软件Expasy分析该基因编码的CYP4H42v2蛋白的理化性质和亲疏水性;利用HMMTOP version 2.0和SignalP 4.1 server分别预测CYP4H42v2蛋白的跨膜结构域以及信号肽;运用NetPhos、NCBI-Conserved domains、SOPMA、SWISS-MODEL、IEDB在线程序分别预测CYP4H42v2蛋白潜在的磷酸化位点、保守域结构、蛋白二级、三级结构及其抗原表位;对其编码的氨基酸序列进行同源比对,利用MEGA X软件构建系统进化树,通过STRING数据库对其蛋白互作网络进行预测。结果CYP4H42v2基因全长1664 bp,开放阅读框为1508 bp,编码502个氨基酸;无信号肽,存在跨膜结构域,为疏水性蛋白,有潜在的磷酸化位点和保守域结构;CYP4H42v2蛋白具有α螺旋、β折叠结构和互变异构酶活性;CYP4H42v2蛋白具有18个抗原表位,在STRING数据库共鉴定出11个相关基因以及43个互作关系。结论利用生物信息学方法预测分析白纹伊蚊CYP4H42v2基因,发现其编码蛋白存在潜在抗原表位,且具有多个磷酸化位点,为CYP4基因在白纹伊蚊抗药性机制的研究中发挥的作用提供理论基础。