基于N6-甲基腺苷修饰与免疫细胞浸润的结直肠癌预后模型构建及验证

作     者：杨菁菁 郭怀娟 茅静贤 王佳欣 王颖 严雪冰 潘晓萍 YANG Jingjing;GUO Huaijuan;MAO Jingxian;WANG Jiaxin;WANG Ying;YAN Xuebing;PAN Xiaoping

作者机构：扬州大学附属医院肿瘤科江苏扬州225000 扬州大学附属医院健康管理中心江苏扬州225000 

出 版 物：《实用临床医药杂志》 (Journal of Clinical Medicine in Practice)

年 卷 期：2024年第28卷第7期

页      面：1-8页

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 100207[医学-影像医学与核医学] 1006[医学-中西医结合] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 08[工学] 1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 100102[医学-免疫学] 100214[医学-肿瘤学] 100106[医学-放射医学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(81902422) 江苏省基础研究计划自然科学基金面上项目(BK20231245) 江苏省卫生健康委面上项目(M2020024) 江苏省科协青年科技人才托举工程(TJ-2022-022) 扬州大学医学创新转化专项基金临床转化研究项目(AHYZUZHXM 202104) 江苏省研究生科研创新计划项目(KYCX23_3621) 江苏省研究生实践创新计划项目(SJCX23_2027,SJCX21-1646) 

主　　题：结直肠癌 N6-甲基腺苷修饰相关基因 免疫细胞浸润 生物标志物 预后 

摘      要：目的探讨N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰相关基因和免疫细胞浸润在结直肠癌(CRC)中的预后价值并构建相应风险模型预测患者临床结局。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)下载CRC患者的肿瘤组织转录组数据及匹配临床信息,通过共识聚类及单样本基因组富集分析明确m^(6)A修饰相关基因及免疫细胞浸润在CRC中的预后价值。基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与两者相关的预后基因,运用Lasso回归分析构建多基因风险模型,并在基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库中对筛选出的预后基因进行表达差异分析。通过Kaplan-Meier生存分析明确风险模型在不同亚组及外部验证队列中的预测效能。结果基于21个m^(6)A修饰相关基因及24个免疫细胞浸润的特征表型均可以显著区分TCGA队列中CRC患者预后。CRC组织中多数m^(6)A修饰相关基因与免疫细胞浸润显著相关。WGCNA及Lasso回归分析筛选出4个预后基因,分别为内凝集蛋白1、淋巴细胞抗原6复合位点G6D、无调性同族体1和基质金属蛋白酶28。在结直肠癌组织中,淋巴细胞抗原6复合位点G6D和基质金属蛋白酶28的表达与癌旁组织比较,差异有统计学意义(P0.05)。基于上述预后基因构建的风险模型能够在TCGA队列的不同临床亚组及GEO验证队列中有效识别预后不良的潜在风险人群。结论基于m^(6)A修饰及免疫细胞浸润构建风险模型能够有效预测CRC患者的临床结局,相关预后基因有望成为抗CRC的潜在分子靶点。