基于网络药理学和分子对接技术分析柴胡-白芍药对治疗肝损伤的作用机制

作     者：陶纯立 冯春艳 TAO Chun-Li;FENG Chun-Yan

作者机构：淄川区中医院中药房山东淄博255100 淄川区医院临床药学室山东淄博255100 

出 版 物：《中国药物经济学》 (China Journal of Pharmaceutical Economics)

年 卷 期：2024年第19卷第3期

页      面：94-100,108页

学科分类：100506[医学-中医内科学] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

主　　题：柴胡 白芍 药对 网络药理学 分子对接 肝损伤 

摘      要：目的基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡-白芍药对治疗肝损伤(LI)的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以口服生物利用度(OB)≥0.30且类药性(DL)≥0.18为条件筛选得到柴胡-白芍药对的活性成分化合物及对应靶点,运用Pubchem平台获取靶点Canonical SMILES号,通过SwissTargetPrediction及TargetNet数据库预测并获取有效靶点;运用GeneCards及OMIM数据库获取LI疾病基因靶点;Venn2.1平台进行拓扑分析,获取疾病与活性成分的交集靶点;将交集靶点导入String数据库,获取蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,靶点网络以PPI阈值0.9为标准,隐藏游离靶点,下载PPI可视化图和交集靶点.TSV文件;运用Excel建立“药物-活性成分-靶点表,导入Cytoscape 3.9软件构建关系网络,并进行可视化;运用DAVID数据库将柴胡-白芍药对治疗LI的作用靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,获取数据,并利用微生信数据可视化平台进行可视化。根据Degree值运用Auto Dock Vina v.1.2.0软件将排名前5的核心作用靶点与柴胡-白芍的核心活性成分进行分子对接,得到对接结合能以及对接结果文件。结果共筛选得到柴胡-白芍药对活性成分27个,包括山柰酚、异鼠李素、槲皮素、β-谷甾醇等;柴胡-白芍药对抗LI的核心靶点216个,排名前5的靶点分别为蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白白细胞介素6(IL6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR);KEGG富集分析结果显示,柴胡-白芍药对抗LI主要涉及PI3K/AKT信号通路、MAPK信号通路等。分子对接结果显示,活性成分与核心靶点的结合构象稳定。结论柴胡-白芍药对可能通过作用于AKT1、TNF、IL6、VEGFA、EGFR等核心靶点,调控PI3K/AKT信号通路、MAPK信号通路等相关通路,发挥治疗LI的作用。