牙鲆mstn基因SNPs位点多态性与生长性状的关联分析
Association analysis of SNPs polymorphisms in mstn gene of Paralichthys olivaceus with growth traits作者机构:中国水产科学研究院北戴河中心实验站/河北省渤海鱼类种质资源保护与利用重点实验室河北秦皇岛066100 中国水产科学研究院渤海渔业研究中心河北秦皇岛066100
出 版 物:《南方水产科学》 (South China Fisheries Science)
年 卷 期:2024年第20卷第2期
页 面:119-128页
核心收录:
基 金:河北省自然科学基金面上项目(C2022107003) 中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2023-TD43) 国家现代农业产业技术体系(CARS-47)
摘 要:为研究牙鲆(Paralichthys olivaceus)肌肉生长抑制基因(mstn)多态性,开发其分子辅助育种新标记,采用重测序方法对120尾牙鲆(3个双克隆杂交家系:60尾;3个雌核发育家系:60尾)的mstn基因进行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,并对不同基因型个体的生长性状进行多重比较及SNP标记验证。结果显示,共检测到7个SNPs位点,均为颠换型突变;外显子区3个(Exonl 1:G2063A;Exonl 3:C3883T,C4009A),为同义突变;内含子区3个(Intron 1:A2444T;Intron 2:T3816C,A3832C);3 端非编码区1个(3 UTR:C4564A)。SNPs与生长性状关联分析结果表明,A3832C和C4564A标记位点与牙鲆体质量、体长、体高等生长性状显著相关(P0.05)。将A3832C和C4564A标记位点在牙鲆生长快速群体(F:60尾)和生长缓慢群体(S:60尾)中验证,验证结果与多重比对结果一致,表明2个SNPs位点具有较高的稳定性。综上所述,研究筛选出了牙鲆mstn基因中与生长性状显著相关的A3832C和C4564A两个标记位点,为牙鲆分子辅助育种提供了理论参考。